在应用聚丙烯酰胺之前，都是先将它配成水溶液。一般是将粉状聚丙烯酰胺缓慢地、小批量地倒进搅拌着的冷水中，搅拌的速度不宜太快，以免过度的剪切引起聚合物分子断裂。搅拌只是为了保证聚丙烯酰胺固体立即分散不致粘结成团。聚合物加入的速度也应随着溶液粘度的增大而降低。稍稍提高温度可以稍微增加溶解速度，但温度不宜超过60℃。高分子量的聚丙烯酰胺的溶液最高浓度为0.5％，而较低分子量的聚丙烯酰胺，其溶液浓度则可配制为1％或稍高一点。在絮凝处理中，溶液还要再稀释到0.02％以下。配制成聚丙烯酰胺溶液后不宜过长时间地存放，以免变质。
阳离子聚丙烯酰胺处理饮用水的 PAM有严格的质量标准，残余单体含量在0.05％以下，用量在2×10-6以下；用以处理食品工业用水如洗菜洗水果的水，或用于食品用包装纸等方面时，也必须有严格的质量标准，经专门机关批准和保证。
非离于性PAM类絮凝剂由于不带离子型官能团，因此，与阴离子型PAM类絮凝剂相比具有以下特点：絮凝性能受废水pH值和盐类波动的影响小；在中性或碱性条件下，其絮凝效果(沉降速度)不如阴离子型，但在酸性的条件下却优于阴离子型；絮体强度比阴离子型高分子絮凝剂的强。
　　阳离子型 PAM的分子量通常比阴离子型或非离子型的聚合物低，其澄清性能主要是通过电荷中和作用而获得。这类絮凝剂的功能主要是絮凝带负电荷的胶体，具有除浊、脱色等功能，适用于有机胶体含量高的废水，例如染色、造纸、纸浆、食品、水产品加工与发酵等工业废水，以及城市下水处理工艺中的污泥脱水等。城市与工业污水常用活性污泥法处理，生化污泥常常是亲水性很强的胶体，所含水极难脱去，若采用阳离于型PAM类絮凝剂，能收到良好的脱水效果。
阴离子型 PAM絮凝剂适用于粒子表面带正电荷的浆体，和阳离子型PAM类絮凝剂相比；阴离子型PAM类絮凝剂分子量较高，而且，由于同一个分子内离子型基团间相互排斥，在水中的分子伸展度比较大，因而具有良好的粒子絮体化性能。它们可有效地用于矿物悬浮液的沉降分离。
当所处理的水是pH为中性到碱性的含无机质多的悬浮液时是适用的。例如，在氧化镁熔炼、锌的冶炼、磷酸等生产工艺中，可作为沉降促进剂。在水处理中，除可用于炼铁高炉、铝加工、造纸、河砂砾洗涤等的废水处理外，还应用在城市下水的一级处理中。
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