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办理进出口备案的流程一般包括以下步骤：

准备材料：企业在申请进出口备案时，需要准备好相应的申请材料，包括进出口备案申请表、进出口合同、委托书、发票、装箱单、提单、报关单等相关单证。
填写申请表：企业根据海关要求，填写完整的进出口备案申请表，并在申请表上加盖公章。
递交材料：企业将准备好的申请材料递交至当地海关备案窗口，进行初审。
初审：海关工作人员对企业提交的备案申请材料进行审核，确保材料齐全、准确无误。审核通过后，海关工作人员将企业提交的备案信息录入系统，并生成备案号。
备案审批：备案信息录入系统后，海关将进行备案审批，对备案申请进行核实。审批通过后，海关将颁发备案证书，并将备案信息录入到海关系统中，企业即可进行进出口货物申报。
此外，还需要进行以下操作：

到商务局申请备案，并领取《对外贸易经营者备案登记表》。
到所在区县工商局变更经营范围，增加“货物进出口，技术进出口，代理进出口”，并到所属区县公安局指定的地点申刻报关专用章。
到所属区县管辖海关办理备案登记的相关手续，并领取《中华人民共和国海关进出口货物收发货人报关注册登记证书》。
到省级出入境检验检疫局办理注册备案登记，并领取《自理报检单位备案登记证书》。
向中国电子口岸申请联合审批，取得入网许可，购ic卡、读卡器、操作系统，从而成为中国电子口岸正式会员。
到省级外汇管理局申请外汇账户开立，出口核销备案。